A avaliação do comportamento é considerada um dos métodos mais práticos, rápidos e não invasivos de análise do bem-estar animal. Por esta razão, o objetivo deste estudo foi avaliar a ocorrência de alterações comportamentais e as suas consequências sobre o bem-estar de porcas e leitões comparando seus comportamentos antes e depois de práticas dolorosas propondo uma metodologia de análise comportamental em substituição a técnica de análise salivar e sanguínea de cortisol. Foram utilizadas 26 fêmeas e 300 leitões aos dois dias de idade. O comportamento foi avaliado por meio de um etograma, com observações a cada cinco minutos, durante uma hora antes e uma hora depois da realização dos procedimentos dolorosos. As práticas dolorosas foram realizadas no período da manhã, por profissionais treinados anualmente. A frequência respiratória das porcas e de uma amostra de leitões foi obtida por contagem do movimento do flanco por minuto, duas vezes dentro de cada observação. O comportamento estudado foi expresso em percentual de animais na atividade no momento avaliado. A comparação de médias foi realizada através da diferença mínima significativa de Fisher (DIFF). Observou-se que leitões ao retornarem das práticas dolorosas para as gaiolas em companhia da porca apresentaram maior vocalização e menor procura pelos tetos na glândula mamária em relação ao período anterior ao manejo. Antes da retirada dos leitões foi observado que as porcas permaneceram mais em ócio. Maiores médias de frequências respiratórias das porcas e leitões foram encontradas no momento do retorno dos leitões às gaiolas de maternidade. Conclui-se que a metodologia comportamental para avaliação de estresse e dor pode substituir coletas de saliva e sangue para análises de cortisol visando facilitar o manejo da colheita nos primeiros dias após o nascimento, dificultado pelo comportamento dos lactentes e o estresse gerado às porcas em amamentação.