Introdução: Em dezembro de 2019 o novo coronavirus surgiu em Wuhan, província de Hubei, China, apresentando-se como uma emergência de sade pública de preocupação internacional. Notou-se que esta doença tem acometimento multissistêmico, podendo afetar diversos órgãos do corpo humano. Objetivo – Levantar a literatura emergente sobre as consequências diretas e indiretas da infeção pelo SARS-CoV-2 (o COVID-19) no sistema gastrointestinal, através de uma revisão integrativa de estudos publicados entre os anos de 2019 e 2021, permitindo reunir os conhecimentos acerca da doença: novos protocolos, novas evidências, informações e impactos do vírus na saúde publica mundial quando nos referimos ao Sistema Gastrointestinal. Métodos – Revisão da literatura publicada entre dezembro de 2019 a janeiro de 2021 em bases eletrônicas, onde foram selecionados artigos baseados em níveis de evidência e correlacionados com os objetivos do trabalho. Resultados – Foram identificados artigos que relacionam o COVID-19 e o sistema gastrointestinal, explicando fisiopatologia, possíveis prognósticos, abordagens revisadas em relatos de casos em pacientes. Conclusão – Impacto direto e indireto da infecção pelo COVID-19 provocaram revisão e mudança de protocolos clínicos e cirúrgicos durante a pandemia, impactando na abordagem em infecções oportunistas, pancreatites, questão nutricional, isquemias mesentéricas agudas e outros procedimentos cirúrgicos no sistema gastrointestinal.