A consolidação da telessaúde no Brasil evidencia a necessidade de Prontuários Eletrônicos do Paciente (PEPs) eficazes. Contudo, sistemas genéricos frequentemente falham em atender às especificidades do cuidado pediátrico e às demandas pedagógicas do ambiente universitário. Este estudo relata o desenvolvimento e a implementação de um PEP customizado para o acompanhamento nutricional presencial e por telessaúde de crianças atendidas em laboratório de práticas em uma universidade comunitária no Sul do Brasil.