A CME é encarregada de toda uma dinâmica de limpeza do hospital onde se tende a evitar a propagação de infecções e precisa-se, com isso, de um fluxo de profissionais capacitados para realizar o trabalho adequado. O objetivo do trabalho é refletir sobre os desafios que circundam o processo de trabalho nas centrais de materiais e esterilização na pandemia por COVID-19. Trata-se de um estudo de reflexão realizado nos meses de Julho e Agosto de 2020, na cidade de Teresina, estado do Piauí. Para embasar a análise crítica à luz da teoria adotada, houve busca por dados em bases de informações em destaque: LILACS, BDENF e MEDLINE. Os resultados foram discutidos e refletidos conforme duas categorias formuladas: CME e o processamento de materiais durante a pandemia de covid-19: rotinas e procedimentos; Reprocessamento de EPI’S: dilema e desafios. Nota-se que faz-se necessário adaptações na rotina de trabalho das equipes nas centrais de materiais e esterilização no contexto pandêmico. Contudo, existe inquietações que foi possível observar acerca da dispensação de recursos necessários para dirimir o risco de contaminação, problemas como insipiência de tecnologia avançada para esterilização e equipamentos de proteção individual foram recorrentes.