O presente trabalho avalia a eficiência de um liner de solo compactado, instalado sob uma lagoa de lixiviado, na contenção do transporte do íon amônio. Para a obtenção dos parâmetros de transporte, realizaram-se ensaios de sorção em batelada com o solo e o lixiviado provenientes da mesma área de estudo. O ensaio de difusão foi conduzido ao longo de 4 dias em uma célula de acrílico (10 cm de diâmetro), constituída por uma camada de 6 cm de solo compactado subjacente a um reservatório de 5 cm de lixiviado. O sistema foi mantido em ambiente termostatizado a 23 ºC, com coletas diárias no reservatório. Ao término do ensaio, o corpo de prova foi seccionado e cada fatia de solo foi submetida à extração dos íons em água destilada sob agitação por 24 h (proporção 1:10 m/m). A partir dos parâmetros calibrados, simulou-se o transporte em escala real para uma lagoa impermeabilizada com geomembrana de PEAD (2 mm) operando com uma densidade média de 2,5 furos/ha. A modelagem constatou um elevado potencial de contaminação das águas subterrâneas, com as concentrações na base do liner ultrapassando o limite normativo de 20 mg/L após 20 anos de operação. Os resultados indicam que um liner de argila compactada abaixo da geomembrane pode não ser suficiente para garantir proteção das águas subterrâneas em cenário realista de furos na geomembrana.