O PNAE é uma das políticas públicas mais antigas do Governo Federal que promove alimentação saudável aos alunos da rede pública de ensino e estimula a agricultura familiar. Objetivou-se com o trabalho descrever a situação do processo de comercialização de alimentos da agricultura familiar para o PNAE, em 31 municípios do Território de Desenvolvimento Entre Rios (TDER). Assim, conduziu-se pesquisa exploratória com auxílio de questionários estruturados, aplicados junto aos gestores locais, responsáveis técnicos e agricultores familiares. Observou-se que 70% dos municípios não cumpriu o determinado pela legislação vigente. Os agricultores reportaram falta de assistência técnica, incentivo e desconhecimento do programa como entraves. Para os gestores e responsáveis técnicos, a baixa variedade e a logística de entrega dos gêneros alimentícios são os principais entraves para o funcionamento do programa. De forma geral, os municípios carecem de atenção quanto à forma de execução do PNAE. A divulgação do programa, fortalecimento da assistência técnica e maior interação entre os atores envolvidos no processo, são ações necessárias para o eficiente funcionamento do programa nos munícipios.